212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0084 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
479 aa  951    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.17 
 
 
467 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  28.31 
 
 
487 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  28.63 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.31 
 
 
447 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.2 
 
 
473 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  27.9 
 
 
498 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.19 
 
 
462 aa  134  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.93 
 
 
471 aa  133  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  27.31 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.15 
 
 
477 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.92 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.85 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  28.37 
 
 
492 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  26.91 
 
 
442 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  28.01 
 
 
456 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  30.44 
 
 
454 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.46 
 
 
490 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.54 
 
 
488 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.88 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.88 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.49 
 
 
471 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.15 
 
 
463 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.75 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  28.3 
 
 
445 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.79 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.2 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.75 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.51 
 
 
483 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.17 
 
 
482 aa  116  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  26 
 
 
577 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  23.31 
 
 
487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2119  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.43 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.48 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.94 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.04 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  25.56 
 
 
452 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.6 
 
 
448 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  26.14 
 
 
478 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  26.96 
 
 
484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  26.51 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  26.51 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.49 
 
 
455 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.38 
 
 
454 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  24.24 
 
 
477 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.11 
 
 
487 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  26.84 
 
 
579 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  27.14 
 
 
471 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  27.99 
 
 
677 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.7 
 
 
476 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  28.39 
 
 
665 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.4 
 
 
457 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.71 
 
 
454 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  25.41 
 
 
458 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  25.3 
 
 
468 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  25.77 
 
 
474 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  26.23 
 
 
465 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  25.1 
 
 
468 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  24.35 
 
 
575 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.79 
 
 
519 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.6 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.49 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  26.73 
 
 
669 aa  97.8  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.9 
 
 
468 aa  97.8  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.47 
 
 
453 aa  97.8  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.35 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.34 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  26.02 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  25.28 
 
 
632 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  26.13 
 
 
452 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.39 
 
 
465 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  27.27 
 
 
466 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  28.37 
 
 
685 aa  93.6  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.82 
 
 
468 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  27.07 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  25.82 
 
 
468 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  25.82 
 
 
468 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  25.82 
 
 
468 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  27.07 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  25.34 
 
 
467 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  25.34 
 
 
467 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  20.8 
 
 
487 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.57 
 
 
657 aa  91.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  25.15 
 
 
467 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  26.79 
 
 
668 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.8 
 
 
478 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  26.36 
 
 
474 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  22.89 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.71 
 
 
475 aa  88.6  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  24.64 
 
 
692 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.54 
 
 
680 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.54 
 
 
680 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  23.02 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.39 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.68 
 
 
473 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  25 
 
 
452 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  25.1 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.82 
 
 
678 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.82 
 
 
678 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.29 
 
 
475 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>