270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0079 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
588 aa  1174    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 
637 aa  147  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.61 
 
 
623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  26.83 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  22.56 
 
 
627 aa  132  1.0000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.17 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  23.73 
 
 
568 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  25.45 
 
 
588 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  32.67 
 
 
647 aa  125  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  30.42 
 
 
696 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  33.81 
 
 
697 aa  124  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  27.73 
 
 
525 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 
566 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  23.91 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  24.2 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 
489 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
858 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  24.44 
 
 
609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 
702 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
858 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  25.4 
 
 
587 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  26.17 
 
 
547 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 
480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
685 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.42 
 
 
477 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.34 
 
 
547 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  26.34 
 
 
547 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  31.98 
 
 
690 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 
463 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  25.67 
 
 
547 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.67 
 
 
547 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  25.67 
 
 
547 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 
547 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.87 
 
 
465 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.69 
 
 
477 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  29.35 
 
 
638 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 
547 aa  108  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  29.58 
 
 
698 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  26.14 
 
 
548 aa  107  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 
547 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.98 
 
 
920 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  22.84 
 
 
541 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 
640 aa  104  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  22.78 
 
 
617 aa  104  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.77 
 
 
478 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 
847 aa  103  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 
471 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  29.49 
 
 
695 aa  103  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  26.25 
 
 
846 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  29.43 
 
 
637 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.53 
 
 
727 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 
645 aa  101  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  31.36 
 
 
652 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 
638 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.29 
 
 
613 aa  101  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  31.36 
 
 
645 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  31.36 
 
 
645 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  23.01 
 
 
608 aa  99.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 
464 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
641 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  30.9 
 
 
627 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.85 
 
 
683 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.76 
 
 
683 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 
680 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  25.98 
 
 
638 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 
641 aa  97.8  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.33 
 
 
458 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.05 
 
 
649 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.05 
 
 
649 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
715 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  31.7 
 
 
688 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  22.87 
 
 
608 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  28.89 
 
 
456 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 
554 aa  94.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 
554 aa  94.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 
554 aa  94.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 
680 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 
458 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 
608 aa  94.4  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  29.69 
 
 
641 aa  93.6  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  29.18 
 
 
458 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.09 
 
 
682 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  29.58 
 
 
644 aa  93.6  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  27.56 
 
 
583 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  29.1 
 
 
642 aa  93.6  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 
708 aa  93.6  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 
641 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  27.21 
 
 
457 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  30.08 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 
641 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  28.18 
 
 
641 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  31.33 
 
 
1363 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  29.87 
 
 
464 aa  92  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 
486 aa  92  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 
1363 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.34 
 
 
622 aa  91.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
660 aa  91.3  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
641 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
641 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>