More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0056 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
461 aa  927    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  31.4 
 
 
467 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.94 
 
 
500 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 
461 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  27.99 
 
 
465 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  30.47 
 
 
484 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  28.3 
 
 
475 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  27.92 
 
 
474 aa  136  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  28.61 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  31.16 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  27.34 
 
 
475 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  27.57 
 
 
484 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  28.32 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 
487 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 
452 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  28.78 
 
 
483 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  28.54 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  27.55 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  28.54 
 
 
480 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  27.29 
 
 
485 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  28.7 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  30.31 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
488 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  30.74 
 
 
457 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  30.88 
 
 
487 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.02 
 
 
605 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  30.59 
 
 
487 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 
487 aa  127  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 
487 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  30.59 
 
 
487 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  30.59 
 
 
487 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  30.59 
 
 
487 aa  127  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  27.69 
 
 
453 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  30.59 
 
 
487 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.88 
 
 
487 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  30.88 
 
 
487 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  30.88 
 
 
487 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.88 
 
 
487 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  30.59 
 
 
487 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  30.88 
 
 
487 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  28.12 
 
 
480 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  26.79 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  27.5 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  28.67 
 
 
486 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28.61 
 
 
487 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  29.91 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  29.58 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.95 
 
 
573 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  29.09 
 
 
524 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  27.1 
 
 
486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.09 
 
 
494 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.97 
 
 
475 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 
475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  24 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 
487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 
460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  29.68 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  27.76 
 
 
481 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  29.81 
 
 
489 aa  114  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 
489 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.09 
 
 
474 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  28.25 
 
 
494 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 
502 aa  113  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  27.01 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 
567 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  26.29 
 
 
473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 
569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  27.25 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  27.42 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  31.13 
 
 
489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  28.27 
 
 
562 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 
565 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  26.59 
 
 
489 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  26.59 
 
 
489 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  26.59 
 
 
489 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  26.59 
 
 
489 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  27.39 
 
 
485 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  30.77 
 
 
477 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  32.53 
 
 
477 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  23.04 
 
 
435 aa  108  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  24 
 
 
435 aa  108  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  27.61 
 
 
478 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  27.34 
 
 
491 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  29.48 
 
 
490 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  32.1 
 
 
518 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
490 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  30.95 
 
 
561 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  27.38 
 
 
478 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  27.04 
 
 
477 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  25.43 
 
 
473 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  27.38 
 
 
478 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  34.88 
 
 
561 aa  106  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 
478 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.67 
 
 
264 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 
593 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  27.8 
 
 
477 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  27.04 
 
 
477 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  34.3 
 
 
553 aa  104  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>