More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0051 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  100 
 
 		 243 aa  501  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  69.29 
 
 		 246 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  68.03 
 
 		 246 aa  339  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  68.03 
 
 		 246 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  68.46 
 
 		 246 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  68.46 
 
 		 246 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  68.46 
 
 		 246 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  68.2 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  68.05 
 
 		 243 aa  335  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  67.78 
 
 		 243 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  67.78 
 
 		 243 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  67.78 
 
 		 243 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  67.78 
 
 		 243 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  67.78 
 
 		 243 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  67.78 
 
 		 243 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  67.78 
 
 		 243 aa  332  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  65.69 
 
 		 246 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  67.37 
 
 		 238 aa  329  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  64.85 
 
 		 246 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  66.53 
 
 		 238 aa  325  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  66.95 
 
 		 238 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 238 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  66.53 
 
 		 238 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  67.23 
 
 		 241 aa  321  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  66.1 
 
 		 238 aa  321  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  65.53 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  67.66 
 
 		 241 aa  318  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  64.46 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  64.83 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  63.33 
 
 		 243 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  63.71 
 
 		 239 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  61.92 
 
 		 242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  64.94 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0010  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 239 aa  311  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 239 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0397  ribonuclease PH  62.03 
 
 		 239 aa  309  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  61.09 
 
 		 239 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  64.05 
 
 		 243 aa  307  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0173  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  301  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  61.76 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  62.39 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0182  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 238 aa  301  8.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  63.22 
 
 		 244 aa  300  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  60.43 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  60 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 239 aa  298  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  298  7e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  298  7e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 243 aa  298  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  296  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  63.79 
 
 		 242 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  58.82 
 
 		 239 aa  295  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  63.79 
 
 		 242 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 237 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 237 aa  294  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  58.72 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 238 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0193  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  62.77 
 
 		 244 aa  291  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 238 aa  289  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  57.81 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 238 aa  288  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3641  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0325  ribonuclease PH  59.24 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  58.9 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  60.42 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  58.05 
 
 		 237 aa  285  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  58.47 
 
 		 250 aa  285  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  60.33 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  60.33 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>