More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0046 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 387 aa  795    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.13 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1647  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.92 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1080  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.4 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1814  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.4 
 
 		 376 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.33 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1765  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.6 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.803337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.87 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.46 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.33 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1991  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.79 
 
 		 375 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 383 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1992  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.14 
 
 		 380 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0274072  hitchhiker  0.000000073122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.79 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2470  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.59 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00847211  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2123  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.14 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.87 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.33 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2188  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.79 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2367  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.86 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0319493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.86 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.473063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02363  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.22 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.14 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.86 
 
 		 384 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.22 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.52 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.25 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.52 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.52 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  49.06 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.52 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1857  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.78 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2121  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.78 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.52 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.06 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1912  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.78 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03183  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.52 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.32 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.14 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.14 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.79 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49380  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.39 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.545113  normal  0.68412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4217  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.65 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.76 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.55 
 
 		 379 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2418  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.26 
 
 		 376 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.508006  decreased coverage  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.07 
 
 		 376 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1668  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.81 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0474135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.17 
 
 		 377 aa  362  8e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3068  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.48 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.76584  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3697  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.58 
 
 		 411 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1804  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.47 
 
 		 386 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0689482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0809  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.32 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.44 
 
 		 376 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.79 
 
 		 383 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2044  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.03 
 
 		 391 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.69 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1531  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.6 
 
 		 371 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1271  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.71 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0077  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.1 
 
 		 388 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0144823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.69 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.17 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.26 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.3 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3066  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 380 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 383 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  0.131095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4199  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50 
 
 		 383 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0319412  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.6 
 
 		 375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.44 
 
 		 377 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1420  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.76 
 
 		 383 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000737808  normal  0.0270135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.53 
 
 		 384 aa  351  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1130  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.47 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002797  N-succinyl-L,L-diaminopimelate desuccinylase  48.25 
 
 		 378 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.12 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0557  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.4 
 
 		 386 aa  351  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.8 
 
 		 374 aa  349  5e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2014  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.81 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.466728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.8 
 
 		 374 aa  349  6e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.77 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1088  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.6 
 
 		 383 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0935088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.87 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.72 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0948  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.54 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  47.24 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.94 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.01 
 
 		 377 aa  346  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  46.77 
 
 		 391 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1734  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.79 
 
 		 377 aa  346  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  44.65 
 
 		 383 aa  346  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.27 
 
 		 377 aa  346  4e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>