More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0033 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 
270 aa  556  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
256 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  37.25 
 
 
474 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  30.98 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  26.92 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  27.48 
 
 
283 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  26.46 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  26.46 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  26.39 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  26.17 
 
 
269 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.98 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  25.98 
 
 
269 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  25.98 
 
 
269 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  25.98 
 
 
269 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  25.98 
 
 
269 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  25.98 
 
 
269 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  26.15 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  27.27 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  30 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.39 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  35.95 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  30.92 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  30.13 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.82 
 
 
558 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  27.94 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  25.9 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.73 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  30.23 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  28.12 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  27.68 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.52 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.52 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  25.48 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  30.92 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  26.95 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  26.3 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  29.39 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  26.77 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  29.88 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  35.71 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  25.94 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  25.09 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  34.64 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  23.14 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  28.35 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  26.53 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  25.09 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  28.23 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  24.52 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  30.68 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  30.46 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  31.79 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  35 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  32.69 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  22.8 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  24.88 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  27.31 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  25.99 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  28.1 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.87 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  28.1 
 
 
281 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  28.17 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  24.68 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  32.08 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  28.11 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  28.17 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  28.17 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  24.4 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  27.31 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  28.29 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  27.31 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  27.59 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  28 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  28.29 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  25.76 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.54 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  26.77 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  28.97 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  30.83 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  33.12 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  26.12 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  27.13 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  31.41 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
264 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  27.13 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  26.87 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
321 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>