More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1807 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  95.48 
 
 
199 aa  389  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  67.03 
 
 
183 aa  258  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  66.85 
 
 
184 aa  257  8e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  67.03 
 
 
184 aa  257  8e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  53.85 
 
 
181 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  51.67 
 
 
180 aa  198  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  50.56 
 
 
183 aa  184  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  50.56 
 
 
183 aa  184  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  47.25 
 
 
181 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  49.73 
 
 
190 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  45.18 
 
 
201 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  47.62 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 
191 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  44.5 
 
 
194 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  49.17 
 
 
199 aa  168  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  44.81 
 
 
219 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  47.28 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 
187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  43.41 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 
209 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  46.49 
 
 
197 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  41.75 
 
 
206 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  43.55 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  46.49 
 
 
201 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  38.54 
 
 
194 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  43.68 
 
 
198 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  44.09 
 
 
309 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 
194 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  44.68 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.9 
 
 
188 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 
307 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 
307 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  42.7 
 
 
193 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  42.47 
 
 
228 aa  147  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  43.68 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  45.77 
 
 
181 aa  145  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
188 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 
189 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 
189 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.05 
 
 
218 aa  144  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 
188 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
184 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.2 
 
 
189 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 
183 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.76 
 
 
188 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 
201 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  41.12 
 
 
197 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  41.12 
 
 
197 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40.84 
 
 
197 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 
188 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  47.18 
 
 
184 aa  140  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  42.37 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  45.07 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  40.21 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  46.48 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  42.7 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.11 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  41.01 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  38.3 
 
 
190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  38.3 
 
 
190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  38.3 
 
 
190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 
224 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  41.4 
 
 
190 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  45.39 
 
 
190 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.22 
 
 
185 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  45.07 
 
 
197 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 
185 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.95 
 
 
196 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.95 
 
 
185 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 
203 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  39.15 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  46.81 
 
 
191 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  46.81 
 
 
191 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  46.1 
 
 
185 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  36.22 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  46.1 
 
 
184 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  40.76 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.34 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  41.21 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  41.21 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  40.11 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  38.66 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  38.66 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.66 
 
 
186 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  35.68 
 
 
191 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 
324 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  35.68 
 
 
199 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  38.42 
 
 
185 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  42.07 
 
 
176 aa  131  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  40.68 
 
 
188 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>