More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1806 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  6.6734e-09 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  80 
 
 
252 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  66.8 
 
 
251 aa  345  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  65.74 
 
 
252 aa  330  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  58.5 
 
 
253 aa  285  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 
254 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 
247 aa  166  3e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 
248 aa  166  3e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 
243 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 
254 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 
253 aa  164  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 
248 aa  164  1e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  37.75 
 
 
252 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  42.2 
 
 
252 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 
252 aa  155  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 
239 aa  148  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 
252 aa  146  4e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  30.61 
 
 
502 aa  119  5e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  30.61 
 
 
502 aa  119  5e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
246 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  6.60342e-09 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
260 aa  114  2e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
253 aa  111  1e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.91 
 
 
266 aa  109  4e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.91 
 
 
266 aa  109  4e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  29.91 
 
 
266 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 
260 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.46 
 
 
285 aa  108  8e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 
285 aa  108  8e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.46 
 
 
266 aa  108  9e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.46 
 
 
266 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.46 
 
 
266 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
270 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
276 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
260 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.57 
 
 
266 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.57 
 
 
266 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.88454e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.57 
 
 
266 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.83389e-11 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.15 
 
 
266 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.15 
 
 
266 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
257 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.15 
 
 
266 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
248 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
264 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.84393e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.12 
 
 
266 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.12 
 
 
266 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.04 
 
 
265 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.67 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2995  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.02 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5371  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.05 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.7 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4899  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.092586  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5552  ABC transporter substrate binding protein (glutamine)  28.87 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.67 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0112  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  28.93 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.95 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
266 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  29.39 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.56 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.15158e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.32 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.98 
 
 
259 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.30479e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.78 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.18 
 
 
263 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
252 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  30.13 
 
 
265 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.11 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.33402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.02 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7091  extracellular solute-binding protein family 3  25.85 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.19 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  27.13 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  28.34 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.56 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6340  extracellular solute-binding protein family 3  26.32 
 
 
270 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.646193  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  29.39 
 
 
259 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
258 aa  92  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0202  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
306 aa  91.7  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  29.28 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  26.22 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  27.54 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.19 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.03966e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>