26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1779 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  621  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  621  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  55.89 
 
 
323 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  46.18 
 
 
317 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  46.18 
 
 
331 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  43.63 
 
 
314 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  44.44 
 
 
314 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  29.96 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  26.35 
 
 
319 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  24.75 
 
 
327 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  22.74 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  22.41 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  23.66 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  27.97 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  24.84 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  23.21 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  26.91 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  23.05 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  22.34 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  19.13 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  23.26 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  21.07 
 
 
378 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  24.34 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  24.34 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0110  hypothetical protein  20.85 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  18.06 
 
 
397 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>