More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1659 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  91.63 
 
 
241 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  90.04 
 
 
241 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  81.09 
 
 
249 aa  402  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  71.95 
 
 
238 aa  315  4e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  53.3 
 
 
682 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  52.42 
 
 
682 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  52.42 
 
 
667 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  52.42 
 
 
667 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.36 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
319 aa  241  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  53.18 
 
 
656 aa  241  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  53.18 
 
 
656 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50.45 
 
 
231 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 
246 aa  234  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  51.6 
 
 
648 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  51.6 
 
 
648 aa  234  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.82 
 
 
230 aa  234  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  49.78 
 
 
653 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  52.25 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  49.56 
 
 
649 aa  232  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.55 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.06 
 
 
647 aa  231  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.9 
 
 
226 aa  231  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  54.07 
 
 
647 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 
240 aa  230  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  48.67 
 
 
650 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  49.57 
 
 
266 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  50.66 
 
 
252 aa  229  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.08 
 
 
253 aa  228  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.17 
 
 
234 aa  228  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.17 
 
 
234 aa  228  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  51.11 
 
 
226 aa  228  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.08 
 
 
253 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  50.45 
 
 
226 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  50.21 
 
 
642 aa  228  9e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  47.35 
 
 
228 aa  227  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
236 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  48.28 
 
 
235 aa  226  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  50.45 
 
 
254 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 
240 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  50.86 
 
 
676 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  50.89 
 
 
225 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 
255 aa  225  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.62 
 
 
234 aa  225  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
643 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  51.82 
 
 
657 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  49.77 
 
 
653 aa  224  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
228 aa  224  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  51.36 
 
 
644 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.75 
 
 
234 aa  224  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  49.32 
 
 
652 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  47.7 
 
 
650 aa  224  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  49.77 
 
 
657 aa  224  9e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  224  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  224  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  224  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
226 aa  224  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
238 aa  223  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
226 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 
226 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  50.45 
 
 
668 aa  223  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.58 
 
 
237 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  50.22 
 
 
656 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
228 aa  223  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.37 
 
 
232 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
286 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.21 
 
 
230 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
646 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
226 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.2 
 
 
657 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.92 
 
 
260 aa  221  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  53.73 
 
 
652 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
222 aa  221  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 
645 aa  221  9e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  50.93 
 
 
220 aa  221  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  51.57 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.23 
 
 
648 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.23 
 
 
648 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.23 
 
 
648 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.75 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.08 
 
 
640 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.61 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.14 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 
222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 
658 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.23 
 
 
678 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  51.11 
 
 
226 aa  219  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.96 
 
 
252 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 
236 aa  219  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  50.46 
 
 
220 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.81 
 
 
239 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.55 
 
 
646 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  48.23 
 
 
678 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>