44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1644 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  86.99 
 
 		 269 aa  484  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  85.87 
 
 		 269 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  65.43 
 
 		 269 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  29.35 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  29.82 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.78 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  30.86 
 
 		 281 aa  131  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  30.29 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  28.52 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  26.95 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  26.95 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  26.95 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  27.43 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  25.39 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.6 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  23.56 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  22.67 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  23.97 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  22.73 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  22.61 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7037  endonuclease IV  21.11 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2685  endonuclease IV  22.39 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.656721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  22.61 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4419  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.62 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.446993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  25.57 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39360  Endonuclease IV  22.28 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.548212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.81 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  28.49 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  22.95 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.12 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.83 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4952  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.22 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  25.45 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5069  endonuclease IV  22.6 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  19.79 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  22.57 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  24.07 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4619  hypothetical protein  28.12 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00487202  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.36 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6413  apurinic endonuclease Apn1  28.05 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  23.57 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  23.2 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.09 
 
 		 270 aa  42  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>