233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1433 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 316 aa  649    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  91.14 
 
 		 316 aa  599  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  75 
 
 		 316 aa  502  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  87.45 
 
 		 255 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  58.82 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  54.7 
 
 		 290 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  37.55 
 
 		 483 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  36.57 
 
 		 483 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.45 
 
 		 502 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  36.88 
 
 		 494 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  35.53 
 
 		 486 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.27 
 
 		 483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  34.93 
 
 		 488 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  32.6 
 
 		 490 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.65 
 
 		 486 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  33.21 
 
 		 489 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  31.4 
 
 		 486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.16 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  34.02 
 
 		 490 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  34.33 
 
 		 528 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  34.09 
 
 		 495 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.56 
 
 		 499 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  35.02 
 
 		 518 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  35.02 
 
 		 518 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  37.29 
 
 		 495 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  33.85 
 
 		 499 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  31.67 
 
 		 484 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  31.67 
 
 		 484 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 495 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  32.97 
 
 		 486 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  32.48 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  34.03 
 
 		 496 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.6 
 
 		 502 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  32.37 
 
 		 529 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.71 
 
 		 526 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  31.71 
 
 		 526 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  31.44 
 
 		 515 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  26.94 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.25 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.16 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  22.97 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  27 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  25.26 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.25 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.25 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  25.26 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  25 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  25.42 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.64 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  24.61 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.2 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  24.91 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  23.15 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.24 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.7 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  24.57 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  24.32 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  23.2 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  24.16 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  24.57 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  22.22 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  22.26 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  25.17 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.57 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  24.57 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.19 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.56 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.27 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  24.72 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  22.74 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  26.28 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  25.08 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  24.81 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  21.1 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.21 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  24.59 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  24.1 
 
 		 456 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.68 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  21.86 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.21 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  25.94 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.94 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  26.56 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  24.26 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.91 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.91 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  22.3 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.91 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  26.23 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  25.94 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  21.79 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.53 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.22 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.62 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.98 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  23.63 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  24.31 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>