More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1165 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  100 
 
 
253 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  94.86 
 
 
253 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  95.26 
 
 
253 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  81.03 
 
 
253 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  55.69 
 
 
255 aa  290  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  55.47 
 
 
256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  55.08 
 
 
256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.45 
 
 
249 aa  175  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.57 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  37.94 
 
 
256 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.7 
 
 
249 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.85 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 
255 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  36.19 
 
 
249 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 
253 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  39.45 
 
 
264 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.22 
 
 
254 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  38.84 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  36.47 
 
 
249 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  34.92 
 
 
251 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
254 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  33.49 
 
 
284 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  32.68 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.5 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.68 
 
 
260 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
281 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 
278 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.53 
 
 
261 aa  125  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 
290 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.48 
 
 
273 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 
289 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 
289 aa  122  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
241 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 
278 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 
277 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  32.69 
 
 
261 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  32.54 
 
 
285 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 
275 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  26.42 
 
 
241 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 
278 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
304 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  32.86 
 
 
276 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
257 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  27.16 
 
 
276 aa  102  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  36.24 
 
 
274 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  35.78 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  35.78 
 
 
274 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
286 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  34.39 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  35.32 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  27.2 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.2 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  26.12 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  27.14 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  32.57 
 
 
284 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  26.75 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  27.08 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  27.17 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  28.83 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  32.52 
 
 
286 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
259 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  27.98 
 
 
252 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  25.4 
 
 
256 aa  88.6  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.97 
 
 
295 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 
254 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  25 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  25 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  33.49 
 
 
284 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  31.13 
 
 
665 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  25 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  26.02 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  25 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  25.4 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  25.21 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>