More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1160 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
433 aa  888    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  95.15 
 
 
433 aa  857    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  95.84 
 
 
433 aa  863    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  83.06 
 
 
433 aa  765    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  63.34 
 
 
433 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  62.27 
 
 
437 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  60.88 
 
 
432 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  58.7 
 
 
431 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  61.34 
 
 
432 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  57.77 
 
 
430 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  57.44 
 
 
433 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  56.94 
 
 
434 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  55.68 
 
 
432 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  57.21 
 
 
433 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  56.74 
 
 
433 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  59.15 
 
 
433 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  56.58 
 
 
432 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  56.81 
 
 
432 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  56.48 
 
 
436 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  56.98 
 
 
435 aa  534  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  57.08 
 
 
433 aa  528  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  56.58 
 
 
432 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  56.81 
 
 
432 aa  528  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  57.38 
 
 
438 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  58.98 
 
 
433 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  55.06 
 
 
435 aa  511  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  54.06 
 
 
434 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  55.32 
 
 
433 aa  511  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  55.29 
 
 
434 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  55.53 
 
 
435 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  55.24 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  55.56 
 
 
433 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  54.97 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  55.79 
 
 
439 aa  504  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  54.97 
 
 
434 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  54.5 
 
 
434 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  54.78 
 
 
436 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  55.14 
 
 
434 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  54.17 
 
 
433 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  53.4 
 
 
435 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  54.97 
 
 
433 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  52.89 
 
 
441 aa  494  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  53.76 
 
 
433 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  54.35 
 
 
435 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  55.09 
 
 
433 aa  495  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  53.81 
 
 
434 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  54.66 
 
 
432 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  53.12 
 
 
433 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  54.25 
 
 
439 aa  487  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  52.69 
 
 
434 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  53.6 
 
 
432 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 
433 aa  485  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  53.04 
 
 
433 aa  484  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  54.01 
 
 
439 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  54.01 
 
 
439 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  52.22 
 
 
444 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  51.96 
 
 
435 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  50.69 
 
 
446 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  52.46 
 
 
444 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  52.22 
 
 
444 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  51.76 
 
 
457 aa  472  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  51.05 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  50.71 
 
 
423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 
441 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 
441 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  49.53 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  49.3 
 
 
437 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
434 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 
432 aa  456  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  49.53 
 
 
436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  50.81 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 
446 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  50.24 
 
 
435 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
433 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  48.06 
 
 
443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  50.82 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  48.84 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  50.35 
 
 
436 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  48.58 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 
434 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  50.23 
 
 
429 aa  444  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
432 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  50.12 
 
 
432 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  49.41 
 
 
445 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  49.65 
 
 
448 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  48.83 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
432 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  50.46 
 
 
439 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  50.23 
 
 
430 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  48 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
434 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  49.19 
 
 
441 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  51.06 
 
 
431 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  48.96 
 
 
441 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  49.08 
 
 
429 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  49.88 
 
 
432 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>