More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1137 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.92 
 
 		 886 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 676 aa  1397    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.99 
 
 		 674 aa  966    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.07 
 
 		 879 aa  679    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.22 
 
 		 677 aa  942    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.24 
 
 		 898 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.28 
 
 		 674 aa  966    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.58 
 
 		 674 aa  948    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.5 
 
 		 689 aa  708    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.07 
 
 		 906 aa  682    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.36 
 
 		 911 aa  678    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  53.08 
 
 		 695 aa  749    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.45 
 
 		 687 aa  788    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.48 
 
 		 893 aa  700    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  97.04 
 
 		 676 aa  1362    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  51.28 
 
 		 745 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  48.46 
 
 		 899 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.65 
 
 		 686 aa  783    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  97.49 
 
 		 676 aa  1369    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.09 
 
 		 688 aa  735    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.53 
 
 		 687 aa  644    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.85 
 
 		 686 aa  690    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.63 
 
 		 685 aa  676    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  53.29 
 
 		 687 aa  734    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.84 
 
 		 674 aa  963    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.26 
 
 		 893 aa  692    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.83 
 
 		 901 aa  657    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.17 
 
 		 917 aa  698    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.93 
 
 		 900 aa  687    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.99 
 
 		 688 aa  755    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  52.82 
 
 		 689 aa  749    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.39 
 
 		 920 aa  639    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.74 
 
 		 893 aa  696    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.65 
 
 		 688 aa  771    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.54 
 
 		 904 aa  702    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.45 
 
 		 688 aa  745    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  50 
 
 		 903 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.71 
 
 		 905 aa  633  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.91 
 
 		 900 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.87 
 
 		 668 aa  630  1e-179  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.24 
 
 		 1421 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.3 
 
 		 1440 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  47.01 
 
 		 1385 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.24 
 
 		 685 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.81 
 
 		 1425 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.81 
 
 		 1424 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.58 
 
 		 1410 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.4 
 
 		 1432 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.24 
 
 		 1428 aa  595  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.09 
 
 		 1425 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.09 
 
 		 1425 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.9 
 
 		 716 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.25 
 
 		 1432 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.09 
 
 		 1432 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  45.14 
 
 		 1387 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.75 
 
 		 716 aa  586  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  42.77 
 
 		 715 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.77 
 
 		 715 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.49 
 
 		 721 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  42.77 
 
 		 715 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.86 
 
 		 1406 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  42.63 
 
 		 715 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.63 
 
 		 715 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  42.63 
 
 		 715 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.65 
 
 		 716 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.94 
 
 		 723 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.39 
 
 		 945 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  42.34 
 
 		 716 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  44.22 
 
 		 1412 aa  575  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.15 
 
 		 724 aa  568  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  42.01 
 
 		 713 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.01 
 
 		 718 aa  569  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.05 
 
 		 1440 aa  568  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.78 
 
 		 716 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.11 
 
 		 541 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.39 
 
 		 925 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.43 
 
 		 662 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  41.45 
 
 		 715 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0473  formate dehydrogenase, chain A  50.27 
 
 		 581 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  41.3 
 
 		 715 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  50.09 
 
 		 526 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.3 
 
 		 715 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.61 
 
 		 937 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.78 
 
 		 718 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.86 
 
 		 963 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.15 
 
 		 1426 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.37 
 
 		 988 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.37 
 
 		 988 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.37 
 
 		 927 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 		 988 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.26 
 
 		 957 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.51 
 
 		 963 aa  535  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.23 
 
 		 961 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.32 
 
 		 1111 aa  532  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.97 
 
 		 924 aa  535  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 		 527 aa  535  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  49.06 
 
 		 527 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 		 754 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.1 
 
 		 888 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 		 989 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>