More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1037 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  92.75 
 
 
552 aa  1042    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  93.84 
 
 
548 aa  1038    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  84.3 
 
 
553 aa  952    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  100 
 
 
552 aa  1128    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  62.5 
 
 
544 aa  660    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  84.3 
 
 
553 aa  952    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  84.3 
 
 
553 aa  952    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  84.3 
 
 
553 aa  952    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  38.75 
 
 
797 aa  270  7e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
628 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
609 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
692 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  37.08 
 
 
640 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  34.47 
 
 
547 aa  247  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  36.73 
 
 
549 aa  246  9e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  37.34 
 
 
551 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  33.4 
 
 
583 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
556 aa  243  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  35.34 
 
 
558 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  33.77 
 
 
654 aa  236  7e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  35.23 
 
 
682 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  35.58 
 
 
591 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  32.96 
 
 
749 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  34.51 
 
 
542 aa  233  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  37.14 
 
 
549 aa  233  9e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
791 aa  232  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
545 aa  229  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
671 aa  229  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.28 
 
 
472 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  33.95 
 
 
1319 aa  228  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  29.76 
 
 
519 aa  227  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
1335 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  42.38 
 
 
438 aa  226  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  34.88 
 
 
991 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  34.38 
 
 
770 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  37.29 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  35.79 
 
 
547 aa  223  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  34.5 
 
 
1255 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  38.92 
 
 
504 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  34.09 
 
 
847 aa  220  6e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  42.55 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  38.76 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.76 
 
 
463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
831 aa  213  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  37.01 
 
 
477 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  41.25 
 
 
521 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  43.75 
 
 
479 aa  213  9e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.88 
 
 
468 aa  213  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  36.32 
 
 
480 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  40.44 
 
 
482 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  35.79 
 
 
438 aa  213  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  40.44 
 
 
482 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.45 
 
 
440 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  35.11 
 
 
460 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  36.39 
 
 
464 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
489 aa  211  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  41.25 
 
 
508 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  38.44 
 
 
467 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  39.81 
 
 
485 aa  210  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  40.52 
 
 
444 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  37.15 
 
 
487 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  44.55 
 
 
677 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  37.08 
 
 
463 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  40.62 
 
 
483 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  37.85 
 
 
455 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  39.08 
 
 
477 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
438 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  36.9 
 
 
452 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
455 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  39 
 
 
441 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  35.9 
 
 
450 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.94 
 
 
462 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  41.09 
 
 
421 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  35.64 
 
 
451 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  40.31 
 
 
488 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  41.09 
 
 
421 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  41.25 
 
 
432 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  41.56 
 
 
476 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  35.73 
 
 
454 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
455 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  35.64 
 
 
451 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  37.29 
 
 
455 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  37.29 
 
 
455 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  37.29 
 
 
455 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  39.37 
 
 
478 aa  207  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  40 
 
 
482 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
485 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  35.71 
 
 
454 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  36.15 
 
 
488 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  43.12 
 
 
473 aa  207  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  39.57 
 
 
482 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  35.73 
 
 
447 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  43.24 
 
 
470 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  39.18 
 
 
453 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  37.26 
 
 
451 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.47 
 
 
447 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  39.2 
 
 
433 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  37.74 
 
 
454 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>