More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0982 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 
265 aa  530  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  96.23 
 
 
265 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  94.34 
 
 
265 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  85.66 
 
 
265 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  69.08 
 
 
262 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  43.51 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41 
 
 
268 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.24 
 
 
265 aa  208  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.53 
 
 
264 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.31 
 
 
266 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.22 
 
 
277 aa  201  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.44 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.15 
 
 
261 aa  199  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.38 
 
 
257 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  40 
 
 
266 aa  192  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.8 
 
 
257 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  38.85 
 
 
266 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.54 
 
 
263 aa  182  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.77 
 
 
266 aa  182  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.83 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  36.33 
 
 
266 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.05 
 
 
256 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  35.11 
 
 
277 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.25 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.35 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.04 
 
 
264 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.62 
 
 
264 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.65 
 
 
266 aa  119  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  28.34 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  25.1 
 
 
320 aa  88.6  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  26.84 
 
 
308 aa  85.5  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  26.55 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  45.78 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  45.12 
 
 
705 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  42.68 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  46.58 
 
 
539 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  45.83 
 
 
557 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  43.75 
 
 
134 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  43.75 
 
 
134 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  38.78 
 
 
133 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  34.74 
 
 
705 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  39.8 
 
 
133 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.37 
 
 
707 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  39.8 
 
 
133 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 
747 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  36.59 
 
 
121 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 
746 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  41.33 
 
 
557 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0966  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 
699 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000874082  normal  0.0188392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.24 
 
 
698 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0159879 
 
 
-
 
NC_002620  TC0230  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.59 
 
 
693 aa  60.8  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.336814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  42.67 
 
 
811 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1096  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.25 
 
 
699 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0013386  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.42 
 
 
698 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0673762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  35.04 
 
 
408 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  38.46 
 
 
399 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  36.78 
 
 
577 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3412  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.42 
 
 
700 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000844924  hitchhiker  0.000972679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1209  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.25 
 
 
702 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2829  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.25 
 
 
699 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000362505  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.25 
 
 
699 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000012543  hitchhiker  0.000000583672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.42 
 
 
699 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000390234  hitchhiker  0.0000000630128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.38 
 
 
703 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1133  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.42 
 
 
699 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000984141  unclonable  0.0000000000121656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3275  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.42 
 
 
700 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000261182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1150  30S ribosomal protein S1  40.28 
 
 
400 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000136012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0380  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.28 
 
 
703 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000345435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  36.7 
 
 
133 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  33.7 
 
 
596 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.62 
 
 
411 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1019  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.86 
 
 
701 aa  59.3  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000461081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  39.36 
 
 
160 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.52 
 
 
687 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  41.67 
 
 
396 aa  59.3  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  39.36 
 
 
161 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  39.36 
 
 
161 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  39.36 
 
 
161 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  31.19 
 
 
387 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  40.43 
 
 
125 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  39.74 
 
 
387 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  43.04 
 
 
711 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 
587 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.19 
 
 
755 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  33.03 
 
 
114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  33.03 
 
 
114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  33.03 
 
 
114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  40.26 
 
 
416 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  38.46 
 
 
382 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.51 
 
 
815 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.97 
 
 
696 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.19 
 
 
702 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 
700 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  44.3 
 
 
128 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  42.11 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>