33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0930 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  100 
 
 		 128 aa  260  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  99.22 
 
 		 128 aa  259  8e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  96.09 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  86.72 
 
 		 128 aa  224  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  64.84 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  56.91 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  50.4 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  46.03 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  52.03 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  47.2 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  46.77 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  46.77 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  44.44 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.14774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  48.39 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  47.15 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  42.19 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  45.24 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  45.08 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  39.68 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  40.48 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  43.44 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  42.62 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  42.62 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1565  30S ribosomal protein S8e  38.89 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1745  30S ribosomal protein S8e  41.84 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179998  hitchhiker  0.00118469 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  40.94 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  40.65 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  48.75 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  39 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.29 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  33.67 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  27.84 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  31.63 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>