76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0907 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  100 
 
 
271 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  95.2 
 
 
271 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  95.94 
 
 
271 aa  494  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  65.07 
 
 
272 aa  366  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.05 
 
 
831 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.07 
 
 
938 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.42 
 
 
817 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  28.57 
 
 
120 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.54 
 
 
820 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.13 
 
 
813 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  22.57 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  30 
 
 
121 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  23.23 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  23.23 
 
 
354 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.55 
 
 
864 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  23.08 
 
 
354 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  23.08 
 
 
354 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  23.08 
 
 
354 aa  52  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  33.8 
 
 
75 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  30.48 
 
 
121 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  36.84 
 
 
80 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  36.84 
 
 
80 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  30.19 
 
 
111 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  30.19 
 
 
111 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  30.19 
 
 
111 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  30.19 
 
 
111 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  30.19 
 
 
111 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  36.99 
 
 
99 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  34.21 
 
 
80 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  36.62 
 
 
76 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  31.88 
 
 
75 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  32.88 
 
 
81 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 
81 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  42.86 
 
 
129 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  29.87 
 
 
79 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  36.92 
 
 
75 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  33.78 
 
 
78 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  29.87 
 
 
79 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 
81 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.18 
 
 
817 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  35.62 
 
 
81 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  35.62 
 
 
81 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  35.62 
 
 
81 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  36.92 
 
 
75 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  28.95 
 
 
83 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  36.92 
 
 
75 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  27.62 
 
 
120 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  35.62 
 
 
81 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  34.72 
 
 
81 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  34.72 
 
 
81 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  34.72 
 
 
81 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  28.95 
 
 
78 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  26.67 
 
 
81 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  24.66 
 
 
76 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  24.66 
 
 
76 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  24.66 
 
 
76 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  24.66 
 
 
76 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  34.72 
 
 
81 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  30.77 
 
 
81 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  34.72 
 
 
81 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  30.26 
 
 
78 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  28.95 
 
 
130 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  32.88 
 
 
81 aa  42.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  33.33 
 
 
84 aa  42.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  32.88 
 
 
81 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  31.94 
 
 
75 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>