50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0885 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  100 
 
 
670 aa  1343  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.03 
 
 
614 aa  467  1e-130  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  24.35 
 
 
591 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0196  hypothetical protein  25.94 
 
 
654 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515468  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  23.18 
 
 
494 aa  97.8  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  26.6 
 
 
697 aa  90.1  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3314  hypothetical protein  27.86 
 
 
654 aa  89.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.949501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.61 
 
 
672 aa  88.2  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  21.69 
 
 
708 aa  82  3e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  27.69 
 
 
676 aa  81.3  5e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.13 
 
 
681 aa  79.7  2e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  27.16 
 
 
660 aa  68.6  4e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2611  hypothetical protein  28.9 
 
 
668 aa  67.8  6e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.47487e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  23.46 
 
 
771 aa  65.5  3e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  40 
 
 
496 aa  56.6  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.04 
 
 
647 aa  55.5  3e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  31.34 
 
 
582 aa  53.9  1e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 
437 aa  51.6  5e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  30.21 
 
 
455 aa  51.2  5e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  40.98 
 
 
430 aa  51.2  7e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.13 
 
 
663 aa  50.8  9e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  30.43 
 
 
403 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  47.17 
 
 
203 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  34.33 
 
 
666 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.43 
 
 
584 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  24.29 
 
 
653 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  25.77 
 
 
688 aa  48.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.19 
 
 
613 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  32.61 
 
 
439 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  30 
 
 
440 aa  47.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.08 
 
 
642 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  30.36 
 
 
427 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  25.44 
 
 
601 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  39.66 
 
 
464 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  29.82 
 
 
440 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  30.11 
 
 
452 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.89729e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  24.04 
 
 
449 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  32.05 
 
 
564 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.83 
 
 
616 aa  45.8  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  42.22 
 
 
482 aa  45.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  29 
 
 
454 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  30.88 
 
 
769 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  27.37 
 
 
641 aa  45.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  27.57 
 
 
613 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  30.77 
 
 
347 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  38.33 
 
 
378 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.99417e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  37.74 
 
 
595 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.1972e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  37.31 
 
 
368 aa  44.3  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  38.46 
 
 
780 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  32.77 
 
 
416 aa  44.3  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>