26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0818 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  100 
 
 
314 aa  613  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  89.81 
 
 
314 aa  540  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  87.33 
 
 
331 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  68.77 
 
 
317 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  46.31 
 
 
323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  45.08 
 
 
317 aa  278  9e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  45.08 
 
 
317 aa  278  9e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  27.12 
 
 
327 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1259  nucleoside recognition domain protein  26.09 
 
 
349 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  23.92 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  23.84 
 
 
318 aa  86.3  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  23.03 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0505  nucleoside recognition domain-containing protein  27.64 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  25.55 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  23.23 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  24.25 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  23.61 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  24.14 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  22.93 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  24.84 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0047  hypothetical protein  19.74 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.369746  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0110  hypothetical protein  22.44 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  21.43 
 
 
362 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  22.73 
 
 
378 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  24.07 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  18.87 
 
 
397 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>