166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0797 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  547  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  97.01 
 
 		 268 aa  532  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  95.9 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  82.51 
 
 		 268 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  65.4 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  35.34 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  32.2 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  29.89 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  31.8 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  32.77 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  31.38 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  33.21 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  30.64 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  28.71 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.67 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  34.22 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  33.78 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.78 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  31.03 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.26 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.89 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  28.78 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  25.11 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.36 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.63 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  30.93 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  32.07 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.94 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  29.74 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  27.13 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  31.77 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  30.56 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  27.01 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  25.91 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  24.71 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  25.81 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  27.56 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.46 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.21 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.89 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  26.61 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  24.91 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  26.14 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.67 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  23.64 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  25.4 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.42 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  24.06 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.4 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  29.13 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  27.37 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  27.31 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  26.98 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  20.78 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  29.38 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.39 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.38 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.37 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.27 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  24 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.98 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.94 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  26.9 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.77 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.69 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  24.29 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9360  apurinic endonuclease Apn1  27.27 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.480693  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  27.23 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1320  hexulose-6-phosphate isomerase  27 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  25.98 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.2 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3293  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.66 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  22.22 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.92 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.6 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8563  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.7 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0314267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.79 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1909  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.85 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1113  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.02 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3271  xylose isomerase domain-containing protein  23.02 
 
 		 295 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.27 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  22 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  24.47 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  23.3 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  19.72 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.54 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  24.4 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  25.33 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  19.72 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  25.37 
 
 		 748 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  23.74 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.26 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  24.49 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  23.89 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  22.22 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0433  xylose isomerase domain-containing protein  23.27 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0782  xylose isomerase domain-containing protein  21.57 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>