More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0757 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  98.9 
 
 
453 aa  885    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  100 
 
 
453 aa  892    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  94.71 
 
 
435 aa  786    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  92.45 
 
 
424 aa  746    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  69.98 
 
 
455 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  56.93 
 
 
455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  56.93 
 
 
455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  57.14 
 
 
455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  57.14 
 
 
455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  57.14 
 
 
455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  57.14 
 
 
455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  56.49 
 
 
455 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  56.93 
 
 
455 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  56.49 
 
 
455 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  56.28 
 
 
455 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  56.57 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  56.19 
 
 
464 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  58.06 
 
 
445 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  53.49 
 
 
463 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  54.28 
 
 
457 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  52.94 
 
 
459 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  53.85 
 
 
459 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  53.59 
 
 
458 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  52.08 
 
 
457 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  51.74 
 
 
458 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  51.74 
 
 
458 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  53.45 
 
 
468 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  51.74 
 
 
458 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  51.74 
 
 
458 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  51.46 
 
 
460 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  52.78 
 
 
462 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  52.07 
 
 
462 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  52 
 
 
460 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  51.43 
 
 
443 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  52.31 
 
 
456 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  50.22 
 
 
458 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  51.75 
 
 
459 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  53.86 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  49.67 
 
 
456 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  55.26 
 
 
445 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  51.72 
 
 
441 aa  415  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  50.78 
 
 
458 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  51.08 
 
 
459 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  51 
 
 
452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  51 
 
 
464 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  50.33 
 
 
452 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  48.7 
 
 
460 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  51 
 
 
452 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  51 
 
 
452 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  50.33 
 
 
459 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  50.33 
 
 
452 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  49.89 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  51.98 
 
 
448 aa  398  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  51.67 
 
 
458 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  49.02 
 
 
452 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  49.02 
 
 
452 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  49.02 
 
 
452 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  52.64 
 
 
470 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  49.02 
 
 
457 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  49.56 
 
 
457 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  49.02 
 
 
452 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  51.85 
 
 
456 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  49.56 
 
 
456 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  50 
 
 
449 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  50.78 
 
 
453 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  53.1 
 
 
454 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  50.88 
 
 
459 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  49.67 
 
 
456 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  50.8 
 
 
449 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  50.11 
 
 
464 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  48.08 
 
 
448 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  48.57 
 
 
471 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  54.02 
 
 
443 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  46.72 
 
 
458 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  49.66 
 
 
467 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  51 
 
 
460 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  50.8 
 
 
447 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02580  amino acid carrier protein  46.04 
 
 
472 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.587535 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  49.08 
 
 
464 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12520  amino acid carrier protein  46.17 
 
 
479 aa  368  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  52.09 
 
 
458 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07220  amino acid carrier protein  46.64 
 
 
479 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.825917  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  53.15 
 
 
487 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  50.79 
 
 
447 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  49.52 
 
 
426 aa  362  9e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  49.77 
 
 
446 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  48.67 
 
 
458 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  50.55 
 
 
461 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  48.42 
 
 
457 aa  360  4e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  47.62 
 
 
450 aa  359  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  47.91 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  50.44 
 
 
490 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0040  amino acid carrier protein  48.64 
 
 
469 aa  353  4e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.489781 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  46.09 
 
 
460 aa  349  6e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  48.51 
 
 
456 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  45.89 
 
 
505 aa  345  8.999999999999999e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0586  amino acid carrier protein  49.67 
 
 
472 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  46.04 
 
 
456 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  43.39 
 
 
456 aa  332  6e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  41.52 
 
 
472 aa  331  2e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>