More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0654 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
132 aa  265  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  99.24 
 
 
132 aa  265  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  98.48 
 
 
132 aa  263  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  94.7 
 
 
132 aa  256  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  87.12 
 
 
132 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  63.36 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  59.54 
 
 
132 aa  163  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  58.78 
 
 
132 aa  161  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  59.54 
 
 
132 aa  156  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  51.91 
 
 
132 aa  146  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  51.91 
 
 
132 aa  144  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 
132 aa  144  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  48.85 
 
 
132 aa  142  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  54.46 
 
 
138 aa  140  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 
132 aa  140  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  55.36 
 
 
141 aa  137  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  48.85 
 
 
132 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  53.23 
 
 
140 aa  134  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  53.33 
 
 
140 aa  133  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  50.41 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  53.51 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  57.89 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  53.33 
 
 
140 aa  126  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  58.77 
 
 
144 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  57.02 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  48.78 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  57.02 
 
 
144 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  55.26 
 
 
144 aa  116  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  41.96 
 
 
122 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0686  50S ribosomal protein L14  38.14 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  41.67 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  43.93 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  42.61 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  44.86 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  37.29 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  42.59 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  43.93 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  42.59 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  42.59 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  40.19 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  40.74 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  41.51 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  41.03 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  39.29 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  42.06 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  43.52 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  40.57 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  39.81 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  37.96 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  40.74 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  42.73 
 
 
122 aa  77  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  41.12 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  40.57 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  44.66 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  40.74 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  40 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  38.68 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf432  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0991  ribosomal protein L14  39.25 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  37.74 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  37.38 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  42.06 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  38.39 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  40.74 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  39.62 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1928  50S ribosomal protein L14  43.27 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  38.89 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  41.51 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  39.17 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  40.74 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  38.98 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  42.31 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  39.62 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  36.79 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  41.67 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  39.25 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  38.89 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  40.74 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  41.75 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  41.67 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  40.57 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  40.74 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  37.5 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  42.16 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  38.32 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  37.96 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2392  50S ribosomal protein L14  39.25 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000369599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  41.51 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  38.89 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  37.96 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  38.68 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  38.68 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  39.62 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>