240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0653 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  88.99 
 
 		 109 aa  203  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  72.64 
 
 		 109 aa  166  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  60.19 
 
 		 106 aa  140  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  56.86 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  57.43 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  53.47 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  57.43 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  56.44 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  63.46 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  55.45 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  49.5 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  51.52 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  49.5 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  46.46 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  45.71 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  44.66 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  46.85 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  41.9 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  41.28 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  46.73 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  44.04 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  52.27 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.9 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  39.62 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  43.4 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  44.68 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  42.2 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  44.04 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  42.2 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  41.03 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  44.59 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  42.31 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2056  30S ribosomal protein S17  42.03 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000496766  normal  0.0517422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  41.98 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  42.47 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  41.25 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0346  30S ribosomal protein S17  41.33 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000061792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  41.25 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  41.25 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  41.25 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  41.77 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1845  30S ribosomal protein S17  41.33 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.018773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  37.66 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  38.37 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  42.47 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  38.75 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  38.75 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  37.84 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  37.66 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  38.75 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  41.18 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  38.75 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  38.75 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  40.51 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  41.33 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  40.74 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  40.51 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1349  30S ribosomal protein S17  33.33 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  32.43 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  39.74 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  39.76 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  38.1 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  41.33 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  37.14 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  36.25 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0113  30S ribosomal protein S17  39.76 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000389804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  40 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  39.47 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  39.44 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  38.03 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  40.28 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  39.08 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  38.16 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0115  30S ribosomal protein S17  38.55 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.46917e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0113  30S ribosomal protein S17  38.55 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152828  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  38.36 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  35 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0119  30S ribosomal protein S17  38.55 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>