243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0648 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 
153 aa  316  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 
153 aa  316  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 
153 aa  316  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  84.31 
 
 
153 aa  275  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  78.43 
 
 
153 aa  257  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  47.68 
 
 
154 aa  153  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  50.33 
 
 
152 aa  153  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  46.71 
 
 
151 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  42.67 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  41.22 
 
 
153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  42.11 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  40.94 
 
 
156 aa  125  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  39.07 
 
 
153 aa  122  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  41.29 
 
 
157 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  41.94 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  41.61 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  36.91 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  39.42 
 
 
159 aa  104  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  36.13 
 
 
156 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  33.99 
 
 
152 aa  100  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  32.89 
 
 
185 aa  99  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  35.29 
 
 
185 aa  98.2  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  39.19 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  35.14 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  30.87 
 
 
185 aa  90.9  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  31.54 
 
 
198 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.71 
 
 
183 aa  83.6  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  38.58 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  33.56 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  34.44 
 
 
184 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  32.03 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  33.8 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  46.58 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  43.84 
 
 
111 aa  57.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  45.21 
 
 
110 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  42.05 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  42.25 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  42.05 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  44.29 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  42.47 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  40.58 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  43.84 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  40 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  44.29 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  39.73 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  38.57 
 
 
113 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  38.36 
 
 
114 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  40 
 
 
114 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  40 
 
 
111 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  40 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  40.3 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  39.44 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  37.66 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  27.94 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  42.03 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  28.47 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  39.73 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  42.86 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  38.36 
 
 
111 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  28.06 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  41.67 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  27.94 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  27.94 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  42.03 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  40 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  39.13 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  40 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>