More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0643 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  90.36 
 
 		 415 aa  762    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 415 aa  830    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  91.08 
 
 		 415 aa  769    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  70.84 
 
 		 415 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  61.81 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  44.28 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  39.66 
 
 		 396 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  40 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  40.77 
 
 		 421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  34.7 
 
 		 409 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.47 
 
 		 404 aa  280  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  35.42 
 
 		 413 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  38.02 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  37.05 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  38.78 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  36.63 
 
 		 410 aa  269  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  35.37 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  37.75 
 
 		 411 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  33.81 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  39.28 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.42 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.04 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.81 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.83 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.67 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.92 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  25.33 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.12 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.12 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.12 
 
 		 419 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.3 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  25.38 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.7 
 
 		 382 aa  99.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3179  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.86 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.43 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.21 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  24.51 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.85 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.37 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.78 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.65 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.11 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 		 365 aa  96.7  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.46 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.71 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.55 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.34 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.62 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.89 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1724  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.98 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  25.76 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1869  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.56 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  26.36 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  26.36 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  26.36 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  24.85 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  25.6 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  24.85 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  24.85 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  24.85 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  24.85 
 
 		 586 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  24.85 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  24.85 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  25.76 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.17 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.49 
 
 		 383 aa  93.6  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.82 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.15 
 
 		 378 aa  93.2  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  24.9 
 
 		 432 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  25.14 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.86 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.22 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.23 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  24.16 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.38 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  24.36 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  25.45 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  25.63 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  26.27 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.11 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  26.32 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  25.57 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 432 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  22.57 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.95 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  24.92 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  25.08 
 
 		 380 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  22 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.56 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.3 
 
 		 380 aa  90.1  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  23.91 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>