181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0576 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
157 aa  306  8e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  92.36 
 
 
157 aa  291  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  89.17 
 
 
157 aa  283  7e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  58.6 
 
 
157 aa  200  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  54.97 
 
 
160 aa  185  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  37.24 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  35.86 
 
 
160 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  37.24 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  31.85 
 
 
159 aa  97.1  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  28.87 
 
 
197 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  26.95 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  30.88 
 
 
200 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  25.71 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  31.58 
 
 
200 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  22.48 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  31.34 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  31.65 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  29.23 
 
 
193 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  24.8 
 
 
195 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4633  hypothetical protein  28.89 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  31.75 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  23.88 
 
 
416 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  33.98 
 
 
249 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  29.93 
 
 
219 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  26.62 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  29.01 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 
237 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  25.4 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  27.89 
 
 
220 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  27.89 
 
 
220 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  28.68 
 
 
208 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.49 
 
 
231 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  29.17 
 
 
202 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  29.41 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  27.89 
 
 
220 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  27.01 
 
 
214 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  23.02 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  29.51 
 
 
212 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  29.13 
 
 
193 aa  48.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3548  membrane protein-like protein  28.1 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  29.05 
 
 
194 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  28.08 
 
 
237 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  27.4 
 
 
213 aa  47.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0535  putative transmembrane protein  26.52 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  25.76 
 
 
208 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  25.74 
 
 
205 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 
221 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  22.95 
 
 
192 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1579  hypothetical protein  27.41 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  31.11 
 
 
232 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  27 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2910  hypothetical protein  26.95 
 
 
181 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  28.89 
 
 
228 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  27.21 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.21 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  26.25 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  28.32 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  24.44 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  29.21 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  29.89 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  29.89 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  26.25 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  23.29 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  28.32 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.54 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.89 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  29.86 
 
 
363 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0636  hypothetical protein  24.31 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1129  hypothetical protein  26.52 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0566076  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  26.42 
 
 
214 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  27.27 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0365  hypothetical protein  30.53 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0487  putative transmembrane protein  26.87 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.528398  normal  0.0272623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3614  membrane protein-like protein  26.45 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  26.72 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0574  hypothetical protein  26.72 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.09 
 
 
206 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.79 
 
 
198 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  25.58 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  27.94 
 
 
202 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  24.29 
 
 
197 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2687  hypothetical protein  23.89 
 
 
214 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493395  normal  0.468955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  27.21 
 
 
219 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0386  hypothetical protein  29.47 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  21.97 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  31.78 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  26.87 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  29.01 
 
 
195 aa  44.7  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>