116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0341 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  75.4 
 
 
500 aa  756    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
500 aa  975    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  54.08 
 
 
506 aa  509  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  46.8 
 
 
505 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 
423 aa  90.9  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.11 
 
 
517 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.18 
 
 
488 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 
512 aa  76.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  30.09 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 
494 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  20.57 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 
482 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  24.81 
 
 
517 aa  66.6  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 
539 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  20.17 
 
 
546 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
487 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  19.95 
 
 
441 aa  63.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 
499 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.51 
 
 
464 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
429 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  19.93 
 
 
539 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  23.87 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3842  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
499 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289536  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
423 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
492 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
482 aa  57.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21.03 
 
 
453 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
426 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
463 aa  57  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 
423 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
504 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  23.7 
 
 
510 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 
504 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
535 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  20.72 
 
 
490 aa  54.3  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 
470 aa  53.5  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
492 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.56 
 
 
506 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 
440 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.56 
 
 
506 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  25.5 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
506 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.88 
 
 
476 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 
475 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  20.56 
 
 
506 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  20.44 
 
 
506 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
477 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
489 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 
471 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
483 aa  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 
506 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  20.38 
 
 
489 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.48 
 
 
490 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 
506 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
534 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
455 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1900  stage V sporulation protein B  23.65 
 
 
509 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000710979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1619  stage V sporulation protein B  23.65 
 
 
509 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00148254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 
490 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  20.34 
 
 
506 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  19.86 
 
 
444 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 
509 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2939  stage V sporulation protein B  19.29 
 
 
522 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000274011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 
490 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2688  polysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 
517 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 
529 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 
583 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 
483 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.98 
 
 
475 aa  47.4  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  19.82 
 
 
486 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 
474 aa  47.4  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
483 aa  47.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  23.48 
 
 
506 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  21.32 
 
 
360 aa  47  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  21.54 
 
 
461 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  27.5 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
522 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 
491 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  17.69 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 
487 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  20.37 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
519 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
449 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  22.07 
 
 
506 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 
489 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>