More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0329 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  93.43 
 
 
411 aa  761    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  93.19 
 
 
411 aa  768    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  81.45 
 
 
414 aa  674    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  100 
 
 
411 aa  810    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  67.96 
 
 
411 aa  543  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  43.95 
 
 
399 aa  326  5e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  45.57 
 
 
403 aa  315  9e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  42.96 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  42.96 
 
 
400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.48 
 
 
400 aa  306  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.8 
 
 
397 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  41.73 
 
 
400 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  38.94 
 
 
393 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  40 
 
 
401 aa  296  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  39.7 
 
 
393 aa  295  7e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  44.1 
 
 
396 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  39.75 
 
 
399 aa  293  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  39.21 
 
 
404 aa  290  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  38.01 
 
 
402 aa  290  4e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  37.44 
 
 
393 aa  289  7e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  40.2 
 
 
400 aa  288  9e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  37.56 
 
 
402 aa  285  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  40.52 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  38.82 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  37.44 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  38.02 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  32.85 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  34.3 
 
 
405 aa  210  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  35.44 
 
 
384 aa  209  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.19 
 
 
405 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  27.63 
 
 
397 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  30.63 
 
 
374 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.43 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.17 
 
 
393 aa  195  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.91 
 
 
355 aa  193  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
393 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  32.99 
 
 
383 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.62 
 
 
344 aa  190  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  32.18 
 
 
384 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  29.71 
 
 
391 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.46 
 
 
374 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.88 
 
 
376 aa  186  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.85 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  29.02 
 
 
391 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.83 
 
 
355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.82 
 
 
357 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.78 
 
 
355 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.96 
 
 
355 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.82 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.42 
 
 
355 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.94 
 
 
354 aa  179  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.42 
 
 
354 aa  179  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
388 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  34.32 
 
 
355 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.21 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.81 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.01 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  33.93 
 
 
355 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.53 
 
 
356 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.27 
 
 
355 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.01 
 
 
355 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  27.38 
 
 
392 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.41 
 
 
357 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.65 
 
 
356 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.14 
 
 
349 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.76 
 
 
359 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.84 
 
 
358 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.05 
 
 
355 aa  169  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  33.12 
 
 
365 aa  169  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.27 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.09 
 
 
356 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  30.37 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.84 
 
 
355 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.94 
 
 
354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.8 
 
 
349 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  29.43 
 
 
820 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  31.94 
 
 
385 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  31.41 
 
 
388 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
347 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  32.25 
 
 
347 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.29 
 
 
358 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.02 
 
 
357 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
830 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.3 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.3 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
827 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.76 
 
 
357 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.55 
 
 
353 aa  153  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  30.99 
 
 
348 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.06 
 
 
353 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0067  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.72 
 
 
449 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  25.4 
 
 
854 aa  151  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0103  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.36 
 
 
476 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000174332  normal  0.950143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0271  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.76 
 
 
476 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  30 
 
 
399 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.24 
 
 
364 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  28.24 
 
 
366 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  27.62 
 
 
828 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  27.3 
 
 
832 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  30.12 
 
 
820 aa  146  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>