115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0310 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  94.5 
 
 
400 aa  778    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  84.42 
 
 
403 aa  707    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  815    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  95.25 
 
 
400 aa  787    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  54.07 
 
 
404 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  48.73 
 
 
406 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  48.05 
 
 
404 aa  346  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  46.25 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  44.91 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 
403 aa  318  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  46.01 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  43.78 
 
 
426 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  40.91 
 
 
424 aa  292  8e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  40.44 
 
 
397 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  34.72 
 
 
388 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  31.87 
 
 
443 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  32.46 
 
 
404 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  31.05 
 
 
389 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  31.58 
 
 
420 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  30 
 
 
410 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  29.85 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  30.77 
 
 
391 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  30.69 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  29.55 
 
 
396 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  32.2 
 
 
353 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  34.28 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  28.95 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  25.18 
 
 
882 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  25.33 
 
 
572 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  26.34 
 
 
584 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  24.31 
 
 
572 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  28.25 
 
 
745 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  22.38 
 
 
746 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  26.42 
 
 
575 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  25.77 
 
 
584 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  30.24 
 
 
409 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.7 
 
 
752 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.27 
 
 
745 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  25.07 
 
 
757 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  26.64 
 
 
575 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  27.88 
 
 
580 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  25.2 
 
 
582 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  22.06 
 
 
762 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  28.03 
 
 
750 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  23.68 
 
 
752 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  31.97 
 
 
379 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25.16 
 
 
769 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  26.28 
 
 
745 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  25.96 
 
 
745 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  25.96 
 
 
745 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  24.77 
 
 
749 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  22.87 
 
 
486 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  26.3 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  24.65 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.05 
 
 
756 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  23.47 
 
 
763 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  23.47 
 
 
763 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  23.63 
 
 
769 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  29.03 
 
 
570 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  23.23 
 
 
766 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  23.47 
 
 
763 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  23.47 
 
 
716 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  23.63 
 
 
844 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  27 
 
 
736 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  26.21 
 
 
555 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  26.55 
 
 
649 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  23.51 
 
 
628 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  24.9 
 
 
657 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  26.75 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  23.61 
 
 
641 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  24.43 
 
 
649 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  23.93 
 
 
727 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  28.33 
 
 
630 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  27.91 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  23.76 
 
 
647 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  26.25 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  25 
 
 
669 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  25.09 
 
 
649 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  24.56 
 
 
649 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  24.78 
 
 
649 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  24.56 
 
 
649 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  23.61 
 
 
644 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  29.44 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  24.78 
 
 
649 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  28.67 
 
 
649 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  24.78 
 
 
649 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  25.55 
 
 
566 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  29.26 
 
 
587 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  24.78 
 
 
649 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  23.47 
 
 
630 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  25 
 
 
604 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  28.02 
 
 
600 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  25.21 
 
 
585 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  22.97 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0862  hypothetical protein  27.05 
 
 
379 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0907  protein of unknown function DUF181  26.37 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  26.38 
 
 
635 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  29.09 
 
 
563 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0841  hypothetical cytosolic protein  27.27 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37495  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0911  protein of unknown function DUF181  26.03 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>