289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0291 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
159 aa  310  7e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  95.6 
 
 
159 aa  301  3e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  94.97 
 
 
159 aa  297  5e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  78.62 
 
 
159 aa  253  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
159 aa  207  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  204  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  202  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 
159 aa  199  2e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 
159 aa  199  2e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
177 aa  196  1e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  60.38 
 
 
159 aa  194  4e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
159 aa  193  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
159 aa  193  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  187  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  184  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 
159 aa  184  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  58.13 
 
 
160 aa  184  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 
159 aa  182  1e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  53.46 
 
 
159 aa  181  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  181  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 
159 aa  180  5e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 
159 aa  181  5e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  180  9e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  180  9e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  180  9e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  180  9e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  180  9e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
167 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
167 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  173  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  50.94 
 
 
160 aa  171  4e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  169  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  169  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
160 aa  168  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  51.57 
 
 
160 aa  162  1e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  48.43 
 
 
159 aa  162  2e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  45.28 
 
 
160 aa  161  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  41.51 
 
 
159 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  147  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  45.91 
 
 
156 aa  146  1e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  46.2 
 
 
159 aa  145  2e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  47.8 
 
 
158 aa  145  2e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  42.94 
 
 
159 aa  145  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  55.03 
 
 
155 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.21376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  40.88 
 
 
159 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  42.77 
 
 
165 aa  139  2e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  46.88 
 
 
154 aa  131  4e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  39.38 
 
 
159 aa  129  2e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  43.4 
 
 
159 aa  124  7e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  38.99 
 
 
145 aa  123  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  48.43 
 
 
154 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  37.34 
 
 
153 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.67091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  35.67 
 
 
158 aa  121  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  38.61 
 
 
154 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 
154 aa  120  1e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  41.88 
 
 
155 aa  117  4e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.20768e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 
162 aa  117  5e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  35.22 
 
 
153 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  35.44 
 
 
156 aa  116  1e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09351e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  36.71 
 
 
154 aa  115  2e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.55884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  37.11 
 
 
150 aa  114  4e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  7.74135e-12 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  36.77 
 
 
159 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 
156 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  41.88 
 
 
157 aa  113  8e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 
156 aa  112  2e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
166 aa  112  2e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
155 aa  112  2e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  36.08 
 
 
153 aa  112  2e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  35.12 
 
 
160 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  32.08 
 
 
156 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  55.95 
 
 
84 aa  108  2e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
156 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  41.36 
 
 
157 aa  108  4e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
162 aa  107  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 
155 aa  107  9e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  37.34 
 
 
152 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.47821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.78909e-07  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 
157 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  28.3 
 
 
156 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  41.14 
 
 
152 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  37.34 
 
 
157 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
156 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.90967e-05  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
157 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  28.3 
 
 
156 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.32782e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
156 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.27435e-06  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1716  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 
156 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  29.19 
 
 
155 aa  104  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  8.61677e-08 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
156 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  28.3 
 
 
156 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.36055e-08  unclonable  3.93257e-11 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
157 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  102  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  28.3 
 
 
156 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.42803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
156 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.70066e-09  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
156 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
156 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.54968e-07  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
156 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.1317e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>