More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0283 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  81.78 
 
 		 247 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  80.66 
 
 		 243 aa  407  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  38.28 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  28.24 
 
 		 502 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  28.24 
 
 		 502 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  27.84 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  24.9 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1122  extracellular solute-binding protein family 3  29.02 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.16 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.16 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1565  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 253 aa  85.1  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  29.69 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.24 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  26.38 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  26.81 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  26.23 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  27.56 
 
 		 990 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  27.56 
 
 		 990 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6340  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.646193  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.33 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.44 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.33 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.44 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.33 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.49 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2702  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.19 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  24.26 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  23.05 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.51 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.51 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.51 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.51 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  24.79 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  26.67 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.51 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.51 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.7 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  23.11 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.71 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  22.44 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.32 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  24.9 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  28.88 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1983  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2584  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  22.67 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>