More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0254 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 
249 aa  517  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  89.16 
 
 
249 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  89.92 
 
 
249 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  80.32 
 
 
257 aa  431  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  63.56 
 
 
250 aa  346  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  64 
 
 
250 aa  342  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  63.6 
 
 
250 aa  340  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  62.9 
 
 
251 aa  334  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  63.56 
 
 
251 aa  330  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  62.1 
 
 
252 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  61.6 
 
 
253 aa  329  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  60.89 
 
 
252 aa  326  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  60.73 
 
 
250 aa  326  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  60.98 
 
 
252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  60.98 
 
 
252 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  60.98 
 
 
252 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  60.98 
 
 
252 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  60.98 
 
 
252 aa  318  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  59.68 
 
 
252 aa  317  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  60.57 
 
 
251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  58 
 
 
253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  54.37 
 
 
255 aa  306  3e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  52.61 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  53.36 
 
 
259 aa  279  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  53.04 
 
 
252 aa  278  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 
262 aa  275  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  51.23 
 
 
268 aa  268  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  50.59 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  46.77 
 
 
253 aa  265  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  51.37 
 
 
256 aa  263  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  46.5 
 
 
285 aa  261  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  47.18 
 
 
255 aa  257  9e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  50.81 
 
 
248 aa  256  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49 
 
 
258 aa  255  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  46.8 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  50.99 
 
 
252 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  48.24 
 
 
257 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  43.87 
 
 
254 aa  234  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  45.12 
 
 
251 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  49.22 
 
 
252 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  43.08 
 
 
257 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  46.22 
 
 
255 aa  229  3e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  44.14 
 
 
262 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  44.62 
 
 
336 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  47.04 
 
 
251 aa  229  5e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  46.27 
 
 
254 aa  224  9e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  44.88 
 
 
253 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  43.15 
 
 
254 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  46.4 
 
 
255 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  43.6 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  44.05 
 
 
254 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  43.15 
 
 
254 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  42.52 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  42.13 
 
 
259 aa  214  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  42.4 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.63 
 
 
264 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  43.44 
 
 
247 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  41.77 
 
 
254 aa  209  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  45.45 
 
 
259 aa  208  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 
259 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 
259 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  39.25 
 
 
268 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 
252 aa  206  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  39.92 
 
 
253 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  39.92 
 
 
255 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.98 
 
 
258 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  38.65 
 
 
258 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.15 
 
 
257 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  37.15 
 
 
257 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  37.15 
 
 
257 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  43.48 
 
 
260 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  43.48 
 
 
260 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  36.36 
 
 
256 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  40.16 
 
 
254 aa  201  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.63 
 
 
237 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  36.36 
 
 
256 aa  198  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  36.36 
 
 
257 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  36.36 
 
 
257 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  40.16 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  36.36 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  35.97 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  35.97 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  39.93 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  35.97 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  37.65 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  36.8 
 
 
259 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 
260 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  40.15 
 
 
273 aa  192  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  40.93 
 
 
259 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  37.98 
 
 
257 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  40.08 
 
 
256 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  38.98 
 
 
259 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>