110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0122 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  90.21 
 
 
286 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  73.24 
 
 
283 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  86.91 
 
 
191 aa  345  4e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  28.37 
 
 
275 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  27.53 
 
 
283 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
293 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  26.32 
 
 
283 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  29.36 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
280 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  28.03 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.67 
 
 
278 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  30.1 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.89 
 
 
274 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
279 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  26.61 
 
 
302 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  25.98 
 
 
254 aa  105  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
287 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  22.76 
 
 
279 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  31.73 
 
 
274 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  26.28 
 
 
280 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  26.21 
 
 
270 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  30.32 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  24.35 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 
293 aa  92  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  24 
 
 
269 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  23.61 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  27.04 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  24.71 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  26.32 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  25.93 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  30.82 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  24.38 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  30.96 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  34.76 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  26.91 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  24.55 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  25.86 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  25.68 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  27.8 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  24.68 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  28.63 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  21.99 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  25 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  21.33 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  26.79 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  22.1 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  19.42 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  27.39 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  24.4 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  24.88 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  21.12 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  26.19 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  26.47 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  31.58 
 
 
240 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  28.87 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  27.7 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  25.78 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  23.57 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  20.41 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  22.07 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.24 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.12 
 
 
352 aa  59.7  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  22.79 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  32.95 
 
 
232 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  32.31 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  33.09 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  28.81 
 
 
256 aa  56.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  33.59 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  30.77 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  33.71 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  33.58 
 
 
219 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  27.08 
 
 
215 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  21.28 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  22.43 
 
 
121 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  30.84 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  29.71 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  23.76 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
255 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  41.1 
 
 
261 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  22.07 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 
329 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
218 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  25.95 
 
 
246 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  28.85 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  22.33 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  22.83 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
991 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  28.04 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 
210 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>