More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0109 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
388 aa  743    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  97.16 
 
 
388 aa  726    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  96.91 
 
 
388 aa  725    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  76.03 
 
 
388 aa  593  1e-168  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  59.69 
 
 
392 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  59.95 
 
 
392 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  59.95 
 
 
392 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  31.68 
 
 
375 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  31.68 
 
 
375 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.96 
 
 
399 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  31.68 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  31.68 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.68 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  31.68 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  31.68 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  30.89 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  30.33 
 
 
387 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  30.33 
 
 
387 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  30.59 
 
 
387 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  30.59 
 
 
387 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  30.59 
 
 
387 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  30.59 
 
 
387 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  30.59 
 
 
387 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  30.33 
 
 
387 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  30.33 
 
 
387 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  29.82 
 
 
385 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 
396 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  29.38 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 
398 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 
445 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  30.29 
 
 
375 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  30.29 
 
 
375 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  30.29 
 
 
375 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  35.03 
 
 
399 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 
400 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.1 
 
 
418 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  32.54 
 
 
375 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 
491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  30.26 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 
469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  30.66 
 
 
467 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  30.66 
 
 
467 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
453 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.26 
 
 
352 aa  125  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  29.26 
 
 
379 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 
474 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 
389 aa  122  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  27.85 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.88 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  26.28 
 
 
424 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.6 
 
 
386 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
413 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  27.46 
 
 
389 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
415 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.98 
 
 
423 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 
485 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
399 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 
416 aa  103  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  28.01 
 
 
320 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 
462 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 
413 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  27.68 
 
 
318 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  28.4 
 
 
460 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  26.16 
 
 
513 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  29.54 
 
 
479 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 
482 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  29.54 
 
 
479 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.61 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
425 aa  90.9  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 
750 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  23.47 
 
 
748 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 
756 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
406 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  22.22 
 
 
460 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 
423 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  23.51 
 
 
436 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  23.45 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 
767 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  25.99 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.8 
 
 
587 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 
751 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  25.16 
 
 
586 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
609 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 
585 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>