More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0085 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  76.8 
 
 		 196 aa  308  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 195 aa  308  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 196 aa  192  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.8 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  28.81 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 243 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 260 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  32.61 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  22.81 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 307 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>