16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0068 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0068  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  731    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.893382  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1834  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  731    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0636  hypothetical protein  77.21 
 
 
354 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.968148  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4817  hypothetical protein  31.58 
 
 
332 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2700  hypothetical protein  34.74 
 
 
361 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2860  hypothetical protein  32.16 
 
 
332 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4905  hypothetical protein  29.87 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  30.74 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1260  hypothetical protein  29.73 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf267  hypothetical protein  26.64 
 
 
244 aa  85.9  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1784  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4471  hypothetical protein  30 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.623888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0288  hypothetical protein  26.61 
 
 
395 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1622  hypothetical protein  29.41 
 
 
345 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.324666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6043  hypothetical protein  24.26 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0372  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>