171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0065 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  63.79 
 
 
626 aa  798    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  100 
 
 
677 aa  1383    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  58.85 
 
 
607 aa  727    Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  100 
 
 
677 aa  1383    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  45 
 
 
672 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  43.97 
 
 
676 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  44.81 
 
 
676 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  44.12 
 
 
672 aa  429  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  42.96 
 
 
676 aa  412  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  42.18 
 
 
674 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  40.68 
 
 
676 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  38.58 
 
 
674 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  40.17 
 
 
668 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  38.56 
 
 
674 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  38.94 
 
 
674 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  38.62 
 
 
670 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  37.34 
 
 
710 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  37.48 
 
 
717 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  37 
 
 
710 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  37.81 
 
 
710 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  36.64 
 
 
710 aa  317  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  32.55 
 
 
724 aa  266  8e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  30.2 
 
 
693 aa  189  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  29.82 
 
 
694 aa  189  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  26.67 
 
 
700 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  28.6 
 
 
689 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  26.97 
 
 
700 aa  183  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  28.38 
 
 
717 aa  171  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  27.12 
 
 
706 aa  170  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  27.24 
 
 
700 aa  168  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  27.98 
 
 
696 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  29.6 
 
 
811 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  25.86 
 
 
703 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  27.89 
 
 
686 aa  158  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  28.27 
 
 
717 aa  156  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  28.22 
 
 
788 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  26.17 
 
 
949 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  26.92 
 
 
695 aa  150  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  29.06 
 
 
618 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  26.67 
 
 
729 aa  146  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  28.25 
 
 
882 aa  145  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  28.06 
 
 
795 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  25.67 
 
 
709 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  30.61 
 
 
841 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  26.11 
 
 
688 aa  137  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  29.82 
 
 
963 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  25.81 
 
 
808 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  25.26 
 
 
796 aa  136  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  31.77 
 
 
551 aa  135  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  26.95 
 
 
680 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  26.89 
 
 
675 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  28.95 
 
 
859 aa  131  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  27.59 
 
 
679 aa  130  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  31.27 
 
 
847 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  26.21 
 
 
682 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  24.62 
 
 
724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  26.46 
 
 
680 aa  129  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  24.57 
 
 
755 aa  128  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  28.99 
 
 
458 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  25.43 
 
 
686 aa  127  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  25.52 
 
 
932 aa  127  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  26.21 
 
 
707 aa  127  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  30.46 
 
 
989 aa  127  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  23.21 
 
 
717 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  29.27 
 
 
915 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  25 
 
 
791 aa  120  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  27.2 
 
 
890 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  31.44 
 
 
876 aa  120  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  29.67 
 
 
660 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  25.8 
 
 
848 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  26.05 
 
 
710 aa  118  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  23.76 
 
 
761 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  27.02 
 
 
667 aa  115  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  28.17 
 
 
739 aa  114  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  26.95 
 
 
1059 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  27.41 
 
 
1064 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  25.75 
 
 
1342 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  30.43 
 
 
873 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  26.43 
 
 
487 aa  88.2  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 
1412 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  34.16 
 
 
467 aa  84  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  24.73 
 
 
556 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  27.54 
 
 
246 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  27.22 
 
 
501 aa  54.7  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  29.03 
 
 
506 aa  54.3  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  26.73 
 
 
507 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  26.73 
 
 
507 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  26.73 
 
 
507 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  28 
 
 
507 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  27.43 
 
 
507 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  28.65 
 
 
506 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  26.97 
 
 
506 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  27.46 
 
 
508 aa  52  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  34 
 
 
507 aa  51.2  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  29.31 
 
 
506 aa  50.8  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  33.02 
 
 
508 aa  50.4  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  25.73 
 
 
509 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  21.96 
 
 
513 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  26.7 
 
 
506 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  25.47 
 
 
506 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0359252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>