21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0036 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  100 
 
 
322 aa  652    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2304  hypothetical protein  32.32 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0839  HNH endonuclease  47.92 
 
 
380 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.126251  hitchhiker  0.00000000857836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0345  hypothetical protein  24.48 
 
 
372 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.215943  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  23.13 
 
 
353 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1005  HNH nuclease  23.86 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4047  hypothetical protein  41.67 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  18.95 
 
 
560 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  38.89 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03050  hypothetical protein  22.22 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  20.49 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  32.41 
 
 
184 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  32.41 
 
 
184 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
585 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2120  HNH nuclease  20 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.459779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2264  HNH nuclease  24.85 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2106  HNH nuclease  20 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.63229  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  25 
 
 
586 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
575 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0400  CRISPR-associated protein  29.27 
 
 
1079 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.519358 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  25.4 
 
 
522 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>