22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0031 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0031  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.154381  hitchhiker  0.000228125 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1653  transcriptional regulator PadR family protein  55.06 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.294087  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0026  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0104  transcriptional regulator PadR family protein  46.24 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0443  transcriptional regulator PadR family protein  43.48 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0425  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0024  hypothetical protein  42.71 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.552032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0244  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1513  transcriptional regulator PadR family protein  43.68 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661269  hitchhiker  0.0000096713 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0566  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.562571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0105  transcriptional regulator PadR family protein  45.12 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1499  HxlR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.353252  hitchhiker  0.00266513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0274  regulatory protein MarR  41.86 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1124  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0128  transcriptional regulator PadR family protein  34.78 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0886  hypothetical protein  40.91 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0197396  hitchhiker  0.002894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1228  hypothetical protein  36.25 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1286  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0628  hypothetical protein  31.52 
 
 		 292 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2488  transcriptional regulator, HxlR family  38.98 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2818  transcriptional regulator, HxlR family  33.82 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>