26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0020 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  92.12 
 
 
292 aa  552  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  36.94 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  35.92 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  36.84 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  35.67 
 
 
305 aa  188  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  35.74 
 
 
309 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  35.86 
 
 
309 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  34.32 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  34.21 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  34.21 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  34.21 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  32.91 
 
 
329 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  30.6 
 
 
322 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  33.81 
 
 
301 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  34.2 
 
 
305 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.38 
 
 
699 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  39 
 
 
697 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  43.22 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  36.28 
 
 
699 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  39 
 
 
697 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2610  hypothetical protein  28.89 
 
 
584 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000187127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  34.35 
 
 
707 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  36 
 
 
704 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  32.26 
 
 
695 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  36.75 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>