17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0015 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0015  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  296  9e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0611  hypothetical protein  94.48 
 
 
146 aa  280  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.163555  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0078  hypothetical protein  73.79 
 
 
143 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  66.9 
 
 
164 aa  197  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  66.9 
 
 
164 aa  197  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  63.38 
 
 
140 aa  189  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0266  hypothetical protein  64.75 
 
 
140 aa  186  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0366322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2050  hypothetical protein  42.47 
 
 
147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.610136  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  37.67 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  38.36 
 
 
157 aa  107  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  34.48 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  26.43 
 
 
158 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  30.09 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0404  protein of unknown function DUF55  31.11 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0316632  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1889  protein of unknown function DUF55  23.68 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1512  hypothetical protein  29.79 
 
 
295 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.223657  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3239  hypothetical protein  27.27 
 
 
363 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0081017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>