More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1784 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  781    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  93.45 
 
 
397 aa  707    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  93.7 
 
 
397 aa  706    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  73.8 
 
 
397 aa  591  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  74.06 
 
 
397 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  74.06 
 
 
397 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  69.02 
 
 
397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  66.5 
 
 
397 aa  544  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  69.77 
 
 
397 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  68.51 
 
 
397 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  68.01 
 
 
397 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  54.66 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
414 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.76 
 
 
400 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  32.3 
 
 
414 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.43 
 
 
399 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.49 
 
 
400 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.19 
 
 
414 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  31.21 
 
 
414 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  31.78 
 
 
415 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  30.1 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.32 
 
 
401 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.73 
 
 
403 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.98 
 
 
402 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.98 
 
 
402 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 
405 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  27.79 
 
 
402 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 
408 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 
398 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  29.71 
 
 
402 aa  156  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.62 
 
 
443 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.64 
 
 
405 aa  155  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 
400 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  27.4 
 
 
402 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  28.89 
 
 
401 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  30.37 
 
 
410 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  27.7 
 
 
399 aa  153  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  29.51 
 
 
409 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  29.77 
 
 
435 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 
419 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  29.24 
 
 
397 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 
399 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.23 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  25.79 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  29.2 
 
 
404 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.23 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  27.23 
 
 
658 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.64 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  28.95 
 
 
404 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
404 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  28.36 
 
 
394 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  28.01 
 
 
401 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.87 
 
 
402 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  26.87 
 
 
387 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
406 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.68 
 
 
657 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 
406 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  26.49 
 
 
399 aa  143  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.23 
 
 
409 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  26.68 
 
 
643 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.23 
 
 
409 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.43 
 
 
387 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  27.79 
 
 
408 aa  143  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  28.47 
 
 
405 aa  142  8e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  30.35 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  30.66 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.2 
 
 
656 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  26.47 
 
 
431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  27.25 
 
 
401 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  27.25 
 
 
401 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.7 
 
 
653 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  27.12 
 
 
394 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.97 
 
 
412 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  29.79 
 
 
371 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 
405 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  29.16 
 
 
670 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  27.82 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  28.41 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  27.23 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  26.52 
 
 
652 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.85 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  25.83 
 
 
649 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  26 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  28.43 
 
 
647 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  27.72 
 
 
656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.43 
 
 
641 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  28.18 
 
 
412 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 
395 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  31.36 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.21 
 
 
642 aa  133  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 
402 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  27.41 
 
 
696 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
463 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  28.61 
 
 
402 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  25.79 
 
 
403 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>