127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1781 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  90.21 
 
 
286 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  73.94 
 
 
283 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  91.62 
 
 
191 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  28.72 
 
 
275 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  25.18 
 
 
283 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  35.84 
 
 
283 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
293 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.3 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  27.42 
 
 
302 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  28.72 
 
 
279 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.86 
 
 
278 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  28.47 
 
 
276 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
254 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.37 
 
 
274 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.25 
 
 
291 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  29.53 
 
 
278 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  27.08 
 
 
270 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
287 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  28.14 
 
 
254 aa  101  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  22.76 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  26.11 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  26.28 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  30.52 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  27.04 
 
 
319 aa  92.8  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  26.05 
 
 
279 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.29 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  27.04 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  31.98 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  23.84 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  29.17 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  26.6 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  34.94 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  25.43 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  28.04 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  25.36 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  26.16 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  24.11 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  23.79 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  24.18 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  23.94 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  27.6 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  24.75 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  20.56 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  25.34 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  25.57 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  25 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  24.44 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.94 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  33 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  23.18 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  28.67 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  23.28 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  22.1 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  28.17 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  24.41 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  27.67 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  23 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  21.61 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  34.31 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  28.95 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  24.32 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.28 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  23.58 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  32.09 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  31.78 
 
 
239 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  28.32 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  24.19 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  28.24 
 
 
261 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  32.06 
 
 
239 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  29.55 
 
 
232 aa  52  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  24.11 
 
 
218 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  32.82 
 
 
242 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  24.3 
 
 
121 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  22.38 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  36.56 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  29.91 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  21.49 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.29 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
209 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
267 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
267 aa  47  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  29.51 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  20.95 
 
 
210 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
236 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  28.28 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  28.79 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>