151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1779 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  93.75 
 
 		 352 aa  671    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  91.48 
 
 		 352 aa  655    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 352 aa  712    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  77.14 
 
 		 351 aa  568  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  67.5 
 
 		 380 aa  501  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  46.32 
 
 		 881 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  47.88 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  46.79 
 
 		 884 aa  295  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  42.74 
 
 		 857 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  40.9 
 
 		 800 aa  295  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.58 
 
 		 859 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  41.28 
 
 		 836 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  41.45 
 
 		 860 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  43.64 
 
 		 838 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  48.72 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  39.72 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  43.79 
 
 		 867 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  43.09 
 
 		 792 aa  289  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  44.9 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.9 
 
 		 863 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  48.58 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  40.48 
 
 		 871 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  40.46 
 
 		 380 aa  285  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  43.7 
 
 		 842 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  47.15 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.73 
 
 		 875 aa  281  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  44.58 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  45.65 
 
 		 565 aa  279  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  41.3 
 
 		 852 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  40.67 
 
 		 859 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  40.67 
 
 		 859 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  40.67 
 
 		 859 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  41.05 
 
 		 779 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  40.85 
 
 		 856 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.84 
 
 		 872 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  39.28 
 
 		 820 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  40.18 
 
 		 859 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  41.3 
 
 		 811 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  40.67 
 
 		 859 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  37.91 
 
 		 416 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  39.94 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  41.9 
 
 		 841 aa  269  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.37 
 
 		 419 aa  264  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  43.08 
 
 		 899 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 		 826 aa  262  8e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  39.3 
 
 		 841 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  41.59 
 
 		 944 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  44.69 
 
 		 327 aa  252  7e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  43.12 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  39.94 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.4 
 
 		 393 aa  242  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  40.32 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  39.43 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  37.27 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.67 
 
 		 741 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.43 
 
 		 737 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.62 
 
 		 737 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  35.98 
 
 		 757 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  36.28 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  35.87 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  35.87 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  34.81 
 
 		 321 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  34.7 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  35.38 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  34.58 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  36.62 
 
 		 325 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  29.93 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  21.35 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  32 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  31.2 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  29.93 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  29.46 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  23.25 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  24.4 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  23.89 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  23.4 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  21.8 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  29.31 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  22.69 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  23.94 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  26.88 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  23.45 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  21.97 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  27.7 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  28.74 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  28.74 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  28.74 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  28.74 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  28.74 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  28.74 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  21.59 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 		 396 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  25.46 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>