More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1708 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  97.57 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  97.92 
 
 		 288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  88.54 
 
 		 306 aa  513  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  73.96 
 
 		 288 aa  431  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  46.02 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  47.04 
 
 		 282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 		 286 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 282 aa  265  8e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  43.43 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.87 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 294 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 333 aa  158  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>