More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1696 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  95.67 
 
 
301 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  92.33 
 
 
301 aa  564  1e-160  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  76 
 
 
302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  59.67 
 
 
304 aa  388  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  41.72 
 
 
324 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  38.7 
 
 
304 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  40.36 
 
 
313 aa  203  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.09 
 
 
551 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  40.8 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  41.22 
 
 
310 aa  199  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 
579 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  41.14 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  40.47 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  38.31 
 
 
304 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  39.67 
 
 
340 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  39.78 
 
 
311 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.24 
 
 
548 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  39.66 
 
 
318 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  40.39 
 
 
318 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  38.64 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  38.64 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  38.64 
 
 
321 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  38.64 
 
 
321 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  38.64 
 
 
321 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  38.64 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  39.53 
 
 
316 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  38.64 
 
 
318 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  38.31 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  38.31 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  37.62 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  36.39 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  33.56 
 
 
308 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  35.45 
 
 
306 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  37.16 
 
 
320 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  34 
 
 
550 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  36.36 
 
 
332 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  38.91 
 
 
312 aa  186  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  39.25 
 
 
326 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  33.33 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  33.67 
 
 
310 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  38.05 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  35.88 
 
 
304 aa  182  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  35.35 
 
 
333 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  39.8 
 
 
323 aa  181  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  36.73 
 
 
334 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  34.69 
 
 
310 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  38.87 
 
 
321 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  38.87 
 
 
327 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  35.87 
 
 
327 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  35.03 
 
 
310 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  37.99 
 
 
309 aa  180  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  35.79 
 
 
306 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  37.25 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  37.23 
 
 
308 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  34.66 
 
 
308 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.3 
 
 
547 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.41 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  35.03 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  38.98 
 
 
309 aa  178  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  39.49 
 
 
320 aa  178  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  35.69 
 
 
306 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  37.54 
 
 
325 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  36.49 
 
 
313 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  34.16 
 
 
325 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  39.59 
 
 
316 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
310 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 
602 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  35.33 
 
 
324 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  34.04 
 
 
328 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  33.09 
 
 
340 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  34.42 
 
 
309 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  42.18 
 
 
306 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  37.09 
 
 
343 aa  176  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  32.97 
 
 
348 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf510  thioredoxin reductase  35.84 
 
 
302 aa  175  7e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  34.86 
 
 
344 aa  175  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  34.04 
 
 
323 aa  175  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  36.6 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  37.68 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  35.88 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  35.33 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  35.25 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  34.51 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  39.55 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  36.05 
 
 
306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  36.1 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.64 
 
 
555 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  35.84 
 
 
311 aa  172  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  35.31 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  33.21 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 
403 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  31.29 
 
 
310 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  35.47 
 
 
321 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  35.15 
 
 
314 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  35.14 
 
 
308 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  33.77 
 
 
395 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>