99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1624 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  267  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  94.89 
 
 
137 aa  255  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  94.16 
 
 
137 aa  253  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0358  hypothetical protein  77.59 
 
 
118 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  121  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  28.17 
 
 
510 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  30.71 
 
 
463 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  29.86 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  26.76 
 
 
464 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  29.86 
 
 
496 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  27.78 
 
 
472 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  28.89 
 
 
488 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  27.86 
 
 
488 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  31.69 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  30.14 
 
 
462 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  25.52 
 
 
446 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  29.63 
 
 
488 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  29.45 
 
 
464 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  37.1 
 
 
447 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  26.76 
 
 
467 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  24.48 
 
 
460 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  31.09 
 
 
438 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  25.95 
 
 
560 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  27.22 
 
 
557 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  47.27 
 
 
427 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  38.33 
 
 
472 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  29.03 
 
 
471 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1862  hypothetical protein  40.3 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0801977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  28.07 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  25.95 
 
 
503 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  26.45 
 
 
452 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  29.46 
 
 
443 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  25.95 
 
 
501 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  28.87 
 
 
472 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  28.06 
 
 
456 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  29.03 
 
 
471 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  28.07 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  26.76 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  28.07 
 
 
142 aa  48.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  27.03 
 
 
481 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  27.82 
 
 
437 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  28.07 
 
 
142 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  26.06 
 
 
453 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  31.21 
 
 
421 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  28.99 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  27.54 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  28.07 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  29.2 
 
 
491 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  30.08 
 
 
467 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  28.8 
 
 
433 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  25.76 
 
 
143 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  33.09 
 
 
437 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  35.48 
 
 
501 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  25.55 
 
 
454 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  30.3 
 
 
444 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  25.85 
 
 
449 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  26.28 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  25 
 
 
490 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  29.68 
 
 
462 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  25.55 
 
 
525 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  27.19 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  25.55 
 
 
528 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  26.9 
 
 
434 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2539  hypothetical protein  30.56 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  24.09 
 
 
465 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  28.46 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  25.85 
 
 
448 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  25.74 
 
 
489 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  26.53 
 
 
447 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0697  hypothetical protein  28.42 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  27.07 
 
 
470 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  26.32 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  25.85 
 
 
448 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0012  protein of unknown function DUF107  28.26 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  37.33 
 
 
445 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  26.32 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  26.28 
 
 
546 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  26.32 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  31.58 
 
 
394 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  41.82 
 
 
452 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  25.55 
 
 
519 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  37.93 
 
 
458 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  24.54 
 
 
508 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  37.93 
 
 
458 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  28.23 
 
 
442 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  26.9 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  25 
 
 
522 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  25.55 
 
 
519 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  25.18 
 
 
473 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  31.03 
 
 
455 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  25.17 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  25.36 
 
 
524 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  31.43 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  27.86 
 
 
453 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  30.63 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  25.44 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
429 aa  40  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  26.72 
 
 
453 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>