115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1602 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  96 
 
 		 400 aa  792    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  84.86 
 
 		 403 aa  712    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  95.25 
 
 		 400 aa  787    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  100 
 
 		 400 aa  816    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  54.81 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  48.22 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  46.88 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  46.13 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  44.13 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  44.94 
 
 		 403 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  44.95 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  43.28 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  41.15 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  41.39 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  34.2 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  32.64 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  32.28 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  32.16 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  31.33 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  29.74 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  30.69 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  30.33 
 
 		 420 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  28.84 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  30 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  32.89 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  28.89 
 
 		 439 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  32.65 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  27.2 
 
 		 572 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  26.24 
 
 		 882 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  26.39 
 
 		 572 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  27.76 
 
 		 584 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.82 
 
 		 746 aa  96.3  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 745 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  27.85 
 
 		 575 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  27.23 
 
 		 584 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  26.54 
 
 		 745 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  24.85 
 
 		 757 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.21 
 
 		 752 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  25.87 
 
 		 582 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  31.97 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  28.16 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  26.87 
 
 		 580 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  24.57 
 
 		 752 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  27.63 
 
 		 575 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  26.92 
 
 		 750 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.37 
 
 		 745 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.37 
 
 		 745 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  26.69 
 
 		 745 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  21.81 
 
 		 762 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25.16 
 
 		 769 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.05 
 
 		 756 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  25.41 
 
 		 763 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  25.41 
 
 		 763 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  25.9 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  22.87 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  25.41 
 
 		 716 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  25.41 
 
 		 844 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  25.41 
 
 		 763 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  25.41 
 
 		 769 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  24.18 
 
 		 766 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  29.57 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  27.03 
 
 		 628 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  25.25 
 
 		 736 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  26.75 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.86 
 
 		 749 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  24.65 
 
 		 607 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  23.93 
 
 		 727 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  26.21 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  28.19 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  24.22 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  27.91 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  22.64 
 
 		 649 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  30.67 
 
 		 657 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  28.19 
 
 		 630 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  28.1 
 
 		 641 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  24.11 
 
 		 647 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  25.4 
 
 		 669 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  24.57 
 
 		 649 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  24.57 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  29.55 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  24.57 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  24.14 
 
 		 649 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  24.46 
 
 		 644 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  25 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  25 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  24.14 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  24.14 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  29.89 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  25.86 
 
 		 604 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  27.72 
 
 		 630 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  22.34 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  25.33 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  25.21 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  27.12 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0862  hypothetical protein  27.05 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0907  protein of unknown function DUF181  27.05 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  28.48 
 
 		 563 aa  56.2  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  28.02 
 
 		 600 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  24.84 
 
 		 644 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0911  protein of unknown function DUF181  26.71 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>